1、抗病抗逆：灌根后，有益菌在作物根系周围繁殖，形成优势菌群，有效阻止有害病原菌的侵入，减少树木根腐病发病几率。有益菌及代谢产物等活性物质能诱导作物产生抗体，增强作物的抗病能力。
2、促进有机物质腐熟：树木根系周围如有未腐熟有机物质，尤其是未腐熟农家肥，霉菌、线虫就会大量繁殖，侵袭树木根系，从而引起根腐病。施入树木根腐一灌灵后，有益微生物能够促进有机物质快速腐熟，不仅阻止灵病原菌侵入树木根系，而且能增加土壤有机物质含量。
3、促进生长：灌根后，有益微生物的代谢产物可以刺激和调节生长发育，使树木新根系萌发，根系发达、茎粗叶茂、光合作用增强、生长发育旺盛。